Структурные подразделения учреждения:

• Детская поликлиника № 2 (пр. Шахтеров, 73) на 250 посещений в смену;
• Детская поликлиника № 16  - (пр. Ленинградский, 12) на 500 посещений в смену;
• Детский санаторий «Журавлик» - (ул. Терешковой, 7) на 125 коек для лечения детей от 3 до 15 лет с соматической патологией;
• Детский санаторий «Чайка» - (ул. Волгоградская, 26 «Б») на 135 коек для детей с 3 до 8 лет;
• Гастроэнтерологическое отделение – (ул. Терешковой, 7) на 39 коек;

Основные виды деятельности:

Амбулаторно - поликлиническая помощь детям Рудничного и Ленинского районов города, а также профилактическая, лечебно - диагностическая, специализированная стационарная помощь детскому населению города.

Учреждение оказывает санаторную помощь детям с ревматологической, кардиологической, гастроэнтерологической, нефрологической и пульмонологической патологиями. На базе санаториев оказывается также социально-реабилитационная помощь детскому населению.

На базе МУЗ «Детская клиническая больница № 2» в течение года свыше 270 тыс. детей получают амбулаторную медицинскую помощь, около 4 тысяч детей – санаторную помощь, более 1 тысячи детей – специализированную стационарную (гастроэнтерологическую) медицинскую помощь.
Лечебная база больницы представлена хорошо оснащенным физиотерапевтическим отделением, включая лазеротерапию, магнитотерапию. В санаториях и поликлинике № 16 оборудованы залы для проведения лечебной физкультуры.

Для лечения детей применяются иглорефлексотерапия, водолечебницы (включающие сауну и бассейн), лечебные ванны. 
МУЗ «Детская клиническая больница № 2» является клинической базой кафедры педиатрии, базой для обучения врачей-интернов Кемеровской Государственной Медицинской Академии, а также базой областного Кемеровского медицинского колледжа для обучения среднего медицинского персонала.